Ming Çin Seddi’nin ikinci kısmının yapılması 16. Yüzyılı bulacaktı. Yavaş yavaş ilerleyen duvarın ikinci kısmı Moğol akınlarının yönünü henüz duvar yapılmamış olan Pekin tarafına çevirdi. Pekin savunması ise o kadar da parlak bir durumda değildi.

Pekin savunması ancak 1540’lı yıllarda iyi bir hale gelebilmişti. 1540’lı yıllara kadar Pekin savunmasında hiçbir ilerleme yokken Moğol korkusu Pekin’i son derece hızlı bir şekilde savunma yapmaya itmişti. Pekin savunması için askerler yeniden yerleştirildi, yeni duvarlar ve hatlar yapıldı, yeni kuleler inşa edildi, hatta ilk kez ateşli silahlar Çin’de duvarlara bile yerleştirildi. Böylesine bir savunmanın sadece 5 sene kadar bir sürede bitebilmesi daha önce Çin tarihinde görülmemiş bir şeydi. Moğol korkusu Pekin savunmasını çok güçlendirmişti.