Anadolu Selçuklu Devleti’nin tecrübesiz kadroları devletin tüm sorunlarına yetişememeye başladı. Özellikle devletin doğu taraflarında yaşanan ilgisizlik 1240 yılında bu bölgede Baba İshak adında birisinin ortaya çıkmasına neden oldu. Baba İshak peygamber olduğunu bile iddia etti ve kendisine bir sürü taraftar topladı.

Ardından sıra silahlanmaya geldi. Tehlikeli kısım ise Baba İshak’ın taraftarlarının ağırlıklı olarak Moğol istilasından kaçan Harzemliler ve Türkmenlerden oluşmasıydı. Yani bu insanlar savaşçı insanlardı. Silahlanma süreci tamamlandıktan sonra ise isyanlar başladı. İlk isyanlar Maraş ve çevresinde başlayan küçük isyanlardı ama zaman geçtikçe önce Malatya sonrasında Sivas’a kadar uzanan bir hatta bir anda büyüme gösterdi. Böylesine bir büyüme ise aslında hiç beklenmeyen bir durumdu ve bu beklenmeyen durum Sultan 2. Gıyaseddin Keyhüsrev’in geri çekilmesine neden olmuştu.